Con la prefectura de Giovanni Battista Audiffredi (1714-1794) la casanatense alcanzará su máximo esplendor, adquiriendo esa universalidad de contenidos que caracterizó sus colecciones hasta mediados del siglo XIX.
Nació en Saorge (Niza) el 2 de febrero de 1714 y recibió el nombre de Julio César, que cambió por el de Giovanni Battista cuando ingresó en 1730 en la Orden Dominicana, adscrita al Convento de Santa María a Formello en Nápoles. Tras finalizar sus estudios en la escuela de maestros ilustres, enseñó como lector en varios conventos de la Provincia Dominicana de Lombardía. En 1749 obtuvo una maestría en disciplinas sagradas y ese mismo año los padres conservadores de la Biblioteca Casanatense de Roma lo eligieron bibliotecario. Diez años más tarde se convirtió en Prefecto.
Hombre de gran inteligencia, Audiffredi encarna la figura del bibliotecario descrita en la entrada de la Encyclopédie. Un contemporáneo, E.Q., escribe arriba. Visconti, en 1785: «El padre Audiffredi, el primer bibliotecario casanatense, se distinguió por todo tipo de informaciones, especialmente bibliográficas. Versátil en literatura y ciencia, es el hombre más enciclopédico que tenemos en Roma. Astrónomo talentoso, anticuario erudito. , buen naturalista, excelente bibliófilo, escribió con elogios en estos diferentes géneros y publicó recientemente una obra sobre las ediciones romanas del siglo XV, llena de bellas informaciones y observaciones».
Dotado de un agudo criterio bibliográfico y de una cultura ilimitada, organiza y administra la biblioteca considerándola no como un campo que debe explotarse en beneficio propio, sino como una institución cuyos recursos bibliográficos deben ponerse a disposición de los estudiosos, a través de fuentes ricas y bien documentadas. catálogos ordenados.
De hecho, su intensa actividad bibliográfica se resume en el Catálogo Audiffredi de todos los libros propiedad en ese momento de Casanatense, que todavía está en uso hoy en día, representando, para una parte de las colecciones históricas de Casanatense, el único soporte de catalogación.
Debido a su experiencia, el duque de Sermoneta encargó al astrónomo Audiffredi la construcción de un reloj de sol en el palacio Caetani, donde se instaló un observatorio que utilizó durante algunos años. También fue coleccionista de medallas antiguas, hallazgos arqueológicos, sellos e instrumentos científicos, que reunió en un pequeño museo de la Biblioteca Casanatense. Murió a la edad de 80 años el 4 de julio de 1794.